Certa vez me confundi e tomei dois comprimidos Zolpidem com água. O efeito é o mesmo?

Nas formulações habituais, não há problema de você tomar a medicação com água, mesmo que seja a forma sublingual. Ela é absorvida. Agora, se não for a forma sublingual, ela necessariamente deve ser tomada com água. Quando ao "dois" que você cita, se você tomou dois e era para tomar um, os riscos não são grandes, em pessoas fisicamente saudáveis, mas certamente não é recomendável tomar além do que seu médico prescreveu.

Sim. Se for a versão sublingual, a absorção provavelmente não será tão rapida quanto seria se você colocasse "embaixo da lingua", mas o efeito da medicação continua o mesmo.