Estou tratando uma balanite, utilizando a pomada Trok G de acordo com o urologista, os sintomas fora

O comportamento que você descreve — manchas que somem em alguns pontos e aparecem em outros durante o uso da pomada Trok G — é relativamente comum e não significa, necessariamente, que o tratamento esteja falhando, mas que a causa da balanite pode não ser apenas infecciosa.
A pomada Trok G contém antifúngico, antibiótico e corticoide, sendo eficaz quando há balanite mista (fúngica e bacteriana) ou inflamação intensa.
No entanto, se as manchas migram de local ou reaparecem após melhora parcial, é possível que exista:
Irritação ou alergia de contato (por sabonetes, pomadas, lubrificantes ou preservativos);
Balanite irritativa não infecciosa;
Dermatite crônica (como líquen plano ou balanite plasmocitária de Zoon);
Ou uma infecção fúngica resistente, como por Candida glabrata, que responde de forma mais lenta.
O ideal neste momento é:
Evitar automedicação prolongada com corticoide, pois pode mascarar os sintomas;
Retornar ao urologista ou a um dermatologista para reavaliar a lesão;
Se necessário, solicitar exame micológico ou cultura da lesão para identificar o agente e ajustar a medicação;
Manter higiene suave, com sabonete neutro, secagem delicada e roupas íntimas de algodão.
Em resumo:
A recidiva de manchas durante o uso da pomada pode indicar irritação, alergia ou fungo resistente;
O tratamento deve ser reajustado com base em nova avaliação clínica e exames;
Evite uso prolongado de pomadas com corticoide sem acompanhamento médico.