Faz 2 anos tive uma conjuntivite viral, desde então não tive mais sossego, já usei vários colírios,

Impossível responder por aqui; procure seu oftalmologista, de preferência especialista em córnea.

As nubéculas que aparecem durante e após conjuntivite viral, são de difícil tratamento. O uso de corticoide tópico de ser usado com supervisão de médico oftalmologista e ser retirado muito lentamente. O PTK, deve ser feito em ultíssimo caso, somente após ter tentado fazer todos os tratamentos possíveis e imagináveis.