Meu noivo foi diagnósticado com ecefalite autoimune faz tratamento com corticoides,imunosupressores,

Olá. Existem diversas formas diferentes de encefalites autoimunes. Cada uma delas pode ter uma evolução um pouco diferente uma da outra. Bem tratados, os paciente tendem a evoluir muito bem (o que você citou, parece estar dentro do que é preconizado mesmo). Discutia com o médico sobre as dores e cabeça e as crises convulsivas para ajuste de medicamentos para controlar esses sintomas. Em princípio, pela informações dadas, não existia uma proibição absoluta à gestação... porém isso depende de muitas coisas que fogem à explicação possível por esse canal. Abraços.