O uso de omeprazol interfere na absorção de suplementos vitamínicos e fitoterápicos, tais como magnésio,

Sim, interfere. Por isso deve ser tomado por até 8 semanas durante crise, úlcera, esofagite/gastrite. Após esse período deve ser tratada a causa (stress, privação de sono, ansiedade, alimentação incorreta) pois o estômago precisa voltar a ser ácido e assim digerir os alimentos, matar as bacterias nocivas e ativar as cascatas das enzimas digestivas.

O melhor a ser realizado, neste caso é consultar-se com um gastroenterologista/hepato de sua confiança, a fim de esclarecer detalhadamente cada dúvida.