Estou tratando uma candidíase com fluconazol mais na terceira semana do tratamento menstruei devo parar

Olá. Como está mencionando terceira semana de tratamento, entendo que o fluconazol seja para uso Via oral, sendo assim, o tratamento poderá ser mantido normalmente. Abçs.

O tratamento com fluconazol é via oral e pode ser feito durante o período menstrual.

Não interfere em nada, pode continuar usando e mesmo que fosse um creme vaginal poderia continuar usando, na verdade deveria continuar usando, mesmo menstruada o creme vaginal não interrompendo o tratamento.