Nao tenho um molar em cima e um em baixo posso usar um aparelho ortodontico?

Sim , mas o melhor tratamento para o caso , é bom que se diga, é feito de maneira natural, isto é: o Prognatismo pode ser feito sem cirurgias , desgastes ou extrações de dentes, sem uso de medicamento e , ainda, feito sem dor alguma.
Da mesma forma é o tratamento pra o caso da falta do dente inferior e superior. Deve-se cuidar para colocar os demais dentes nas suas posições , sem alterar o tamanho que cada um tem naturalmente, para que a oclusão ou "engrenamento" entre os dentes superiores e inferiores coincida .Caso contrário haverá problemas de dores e com a Articulação Temporo Mandibular ou ATM.

O tratamento ortodôntico, muitas vezes posiciona os dentes adjacentes às falhas dos dentes que precisaram ser extraídos. Isto coloca os demais dentes em melhores condições, favorecendo a colocação de um implante ou prótese que reabilite a arcada, pela falta destes elementos. Isto tudo além de alinhar e nivelar os demais dentes. Caso seja esta sua necessidade também, o planejamento é feito considerando-se o melhor posicionamento para favorecer a longevidade de sua oclusão. Considere também que, fazendo um tratamento ortodôntico, vc recebe também orientações de como cuidar melhor de seus dentes, evitando perdas futuras.

sim, e deve! O uso do aparelho ortodôndico irá alinhar e nivelar seus dentes, deixando o espaço que era ocupado por estes molares no tamanho correto para que haja uma posterior reabilitação (colocação de prótese com o uso de implantes, pontes fixas, pontes móveis, ou outro procedimento recomendado pelo se dentista)

Falha dentária não contra-indica a ortodontia.