Bati minha primeira ultra com 5 semanas de gestação, pois falei a data da última menstruação errada

Excelente pergunta — e ela é muito comum no início da gestação.
No seu caso:

A primeira ultrassom (5 semanas) não mostrou embrião com medida confiável, então não serve para datar com precisão.

A segunda ultrassom, feita com 6 semanas e 4 dias, já foi capaz de visualizar melhor o embrião, então essa é a que vale para contar a idade gestacional.

Quando há dúvida sobre a data da última menstruação ou diferença nos cálculos, o que vale como referência é a primeira ultrassonografia precoce, feita até 12 semanas.

No seu caso:

A primeira ultrassonografia, mesmo feita cedo, mostrou 5 semanas.

A segunda, feita 15 dias depois, mostrou 6 semanas e 4 dias — diferença normal, já que existe margem de erro de alguns dias nos exames iniciais.

A idade gestacional deve ser ajustada a partir dessa primeira fase (até 12 semanas), pois é quando a medida é mais precisa. Depois disso, os bebês crescem em ritmos diferentes, e a ultrassonografia pode mostrar variações que não mudam a idade gestacional real.

Portanto, seu médico vai se basear no primeiro ultrassom precoce para calcular as semanas e a DPP.”