Pantoprazol 40 tem a mesma eficácia de tratamento que o dexilant 60 ? Qual a diferença ?

Olá! Os protetores gástricos de uma maneira geral são equivalentes nos seus resultados, porém eles precisam ser utilizados nas doses adequadas,tomados de maneira adequada e por um período determinado para apresentarem os resultados esperados.

Farmacologia(ciência que estuda os medicamentos) é bastante complexa.

Imagine assim: o bom Médico deve saber no mínimo a dose do medicamento, o horário correto de uso, as contra-indicações, as eventuais interações com outros remédios e os efeitos colaterais. Isso é o mínimo que temos que saber em cada medicamento que prescrevemos. E veja que isso não é fácil.

E isso exige estudar a Farmacologia e saber muito de nosso paciente também.

Por exemplo, o mesmo remédio pode ter doses diferentes dependendo da idade, peso e altura, sexo e doenças concomitantes. Outro exemplo: a dose para uma criança normalmente difere da de um adulto e a dose para uma pessoa com problemas sérios de fígado ou rim muitas vezes é modificada, etc.

As medicações que fala são do grupo dos IBPs. São medicações muito eficazes e seguras.
Normalmente os IBPs são usados no tratamento da Doença de Refluxo(e esofagites), gastrites, duodenites , para proteção do aparelho digestivo quando em uso de medicações agressivas, como parte do tratamento do H. pylori(associado a antibióticos), entre outros.

Médicos experientes sabem definir a melhor dose para cada paciente.
Um bom Médico sabe também que alguns dos IBPs funcionam melhor se tomados em jejum de manhã. Outros podem ser tomados a qualquer hora, e no caso, são indicados para quem trabalha e pode esquecer de tomar em uma hora determinada. Alguns podem ser tomados mesmo durante as refeições. Mas deve-se conhecer o comportamento Farmacológico de cada um dos IBPs.
Eu mesmo, em muitos pacientes atendidos presencialmente ou online, vejo tratamentos que os horários para tomar os IBPs estavam inadequados. Isso é relativamente comum. Por exemplo, não se deve passar um IBP que funciona melhor em jejum para ser tomado durante o dia. E nem é preciso obrigar o paciente que trabalha o dia todo a levantar cedinho só para tomar um tipo de IBP. É melhor adaptar o IBP ao paciente, e não o paciente ao IBP.

Quanto á eficácia, aprendi após tantos anos(mais de 20) prescrevendo IBPs que esta é individual, como tudo em Medicina.
Ás vezes vejo prescrição de IBPs "da moda" apenas por que estão na moda, tem muita propaganda e são muito divulgados. E outro IBP, ás vezes mais barato, poderia ter o mesmo efeito para o paciente.

No seu caso recomendo que não modifique o tratamento por sua conta. Em caso de dúvidas, um Médico experiente deve ser consultado.