Tenho extra-sistóle ventricular benigna já diagnosticada por um cardiologista, porem, percebo que ela

Sentido tem, dependendo da posição, nós podemos sentir mais o coração ou não. Não acredito que haja relação com problemas de estômago.
Se tiver incomodando, pode ser prescito algum medicamento para melhorar e, se o cardiologista achar necessário, um Holter de 24h poderia elucidar melhor essa relação da posição com a arritmia.

Não existe uma relação entre a ocorrência de extra-sístoles e a posição na qual deitamos. Entretanto, toda vez que deitamos do lado esquerdo (decúbito lateral esquerdo), fazemos com que o coração se aproxime da caixa torácica. Com isto, as vibrações das extra-sístoles se propagam mais facilmente pra nossa caixa torácica e, desta forma, um fenômeno que normalmente é imperceptível, tem maior probabilidade de ser percebida pelo paciente.
Espero ter ajudado!

O problema da extra-sístole ventricular não tem relação direta com a posição ao deitar, etc...tão pouco com probreblas estomacais como causador, porém problemas estomacais relacionados com diarreia por exemplo onde poderia ocorrer perda expressiva de eletrólitos pelas fezes e processo de desidratação neste caso poderia estar relacionado com o desencadeamento de algum tipo de arritmia por motivo da depleção de eletrólitos no organismo, principalmente sódio e potássio...