É a cirurgia idealmente realizada para os casos de hiperplasia prostática benigna, quando o volume da próstata já é muito grande (normalmente acima de 80 gramas) e a cirurgia já não pode ser realizada pelo canal da uretra (a chamada ressecção endoscópica ou transuretral da próstata). O objetivo dessa cirurgia é retirar apenas o tecido prostático que está com volume aumentado e comprime o canal da uretra e a bexiga, dificultando a micção. A próstata não é completamente retirada na prostatectomia supra-púbica, ao contrário dos pacientes submetidos à prostatectomia radical para câncer de próstata, o que faz com que a cirurgia seja mais rápida e menos agressiva, com menor taxa de complicações.